samedi 17 octobre 2020

10 Février 2020 - Charbel Massaad et la lutte contre la fraude

 Charbel Massaad et la lutte contre la fraude

Traduit en français depuis le site de Leonid Schneider

Charbel Massaad est responsable des sciences biomédicales à l'Université Paris Descartes. Il a même présenté sa candidature au poste de recteur, plaidant pour l'éthique scientifique. Sans ironie aucune.

La science française est un milieu de fous. Il y a tellement de falsification de données que je ne peux personnellement pas suivre, et ne rapporte que les cas que je trouve intéressants moi-même, pour des raisons obscures et perverses (peut-être que cet article de Mediapart dans lequel je suis décrit comme un harceleur sexuel nazi y contribue). D'où mes sincères excuses à tous ces tricheurs français sur lesquels je n'ai pas réussi à écrire. Cela ne veut pas dire que vous êtes moins importants.

Toutes mes excuses à Monsieur et Madame Egly de l'Université de Strasbourg, ces deux chercheurs en cancérologie ont de beaux enregistrements sur PubPeer : 15 articles pour Cécile Rochette-Egly, et seulement 6, mais haut de gamme, pour Jean-Marc Egly. Ce dernier, connu à Strasbourg pour une personnalité un peu violente, s'est montré pourtant très poli en commentant sur PubPeer à propos de cet article :

Il y en a beaucoup plus dans Compe et al MCB 2005.

Monsieur Egly a posté des données fraîchement préparées et a informé tout le monde :

« Nous avons pleinement confiance dans les résultats et les conclusions du document. Cependant, dans l'intérêt de maintenir l'exactitude de la littérature scientifique publiée, nous souhaitons contacter l’éditeur de Molecular and Cellular Biology. #1 La duplication d'image résulte d’une négligence lors de la construction de la figure 4, qui contient plus de soixante blots différents. »

S'il le dit. Mais maintenant, passons à un autre scientifique de haut rang en France : le neuroscientifique et toxicologue Charbel Massaad. Il est directeur de la Faculté des sciences fondamentales et biomédicales de l'Université Paris-Descartes, qui regroupe 4 instituts de recherche du CNRS et de l'INSERM. A ce poste, Massaad est le patron direct du fondateur de PubPeer et scientifique CNRS Brandon Stell, employé dans l'une de ces 4 unités, l'Institut des Neurosciences Saints-Pères Paris. Ce qui conclut probablement mon triptyque sur le patron de Stell, commencé par la biologiste en chef du CNRS Catherine Jessus (blanchie, les critiques persécutés, mais qui a finalement démissionné), sur la présidente du CNRS Anne Peyroche (détrônée, humiliée par les conclusions de fraude, et désormais punie symboliquement de 2 semaines de suspension parce que les conclusions sont inchangées), et maintenant, Massaad.

Images originales : campagne Massaad, PubPeer, Chronicle Higher Ed.

J’ai essayé d’obtenir l’avis d’expert de Stell sur les articles de la liste PubPeer du laboratoire Massaad, mais je n’ai reçu aucune réponse. Ce qui est compréhensible : je suis bloqué par PubPeer sur Twitter, et Stell lui-même a dit un jour que le monde serait meilleur sans mon site Web. Mais alors, comment le monde saurait-il tout ce que les patrons de Stell ont publié sur la fausse science Photoshoppée ?

Massaad a récemment présenté sa candidature à la présidence de son université, avec sa page de campagne. Son programme avait 9 objectifs, voici l'un d'entre eux :

« # 8 Université éthique et responsable.

Implanter les normes de qualité sur les procédures administratives, les plateformes de recherche et les diplômes

Former les EC, chercheurs, IATSS et ITA durant leur période de stage à l’éthique scientifique et aux enjeux de la lutte contre la fraude

Former les étudiants dès la licence et durant toutes leurs études

(Master et thèse) à l’éthique scientifique

Mettre en place un réseau de correspondants « intégrité scientifique » dans les laboratoires en lien avec le référent intégrité en central »

Ça a l'air génial, mais peut-être que Massaad devrait commencer cette formation en éthique de la recherche par lui-même ? Regardez ça :

Julien Grenier , Amalia Trousson , Anne Chauchereau , Larbi Amazit , Audrey Lamirand , Philippe Leclerc , Anne Guiochon-Mantel , Michael Schumacher , Charbel Massaad Selective recruitment of p160 coactivators on glucocorticoid-regulated promoters in Schwann cells Molecular Endocrinology (2004) doi: 10.1210/me.2004-0241

C'est un peu un gâchis plutôt frauduleux, avec des bandes de RT-PCR 18S clonées et réutilisées à l'intérieur du même gel et entre différentes figures, où les protéines SRC 1, 2 et 3 en Western blot sont interchangeables et deviennent même parfois de l’actine. Massaad n'est certainement pas inquiet, a-t-il finalement commenté (avec faute de frappe) :

« Julien Grenier et moi-même avons récupéré une grande partie des données brutes hier. Nous les examinons actuellement et répondrons dans les plus brefs délais à vos commentaires. »

Le message a été cosigné par Julien Grenier, aujourd'hui professeur associé au département Massaad de l'Université Paris-Descartes, unité T3S (Toxicité environnementale, cibles thérapeutiques, signalisation cellulaire et biomarqueurs). Avec Grenier et Massaad enquêtant, qui sera le bouc émissaire malchanceux de ce journal ?

Massaad a posté un commentaire identique sur un article sœur, publié 2 ans plus tard, où la fausse figure 3B de Grenier et al 2004 est revenue en tant que figure 5D de Grenier et al 2006, avec quelques faux supplémentaires en extra :

Julien Grenier , Amalia Trousson , Anne Chauchereau , Jean Cartaud , Michael Schumacher , Charbel Massaad Differential recruitment of p160 coactivators by glucocorticoid receptor between Schwann cells and astrocytes Molecular Endocrinology (2006) doi: 10.1210/me.2005-0061

Ainsi enhardis, les auteurs ont déversé encore plus d’éléments fabriqués avec Photoshop dans cette « étude scientifique », certains encore réutilisés à partir de l'article artificiel de Grenier et al 2004, certains falsifiés de novo :

Il faut avoir des couilles pour publier une telle abondance d’images photoshopées surréalistes, puis de se déclarer champion de l'intégrité de la recherche dans une campagne de rectorat universitaire. Pourtant, c'est ce que Massaad a fait, sans ironie. Ce n'est pas comme si ces deux articles étaient des exceptions.

Joelle Makoukji , Martin Belle , Delphine Meffre , Ruth Stassart , Julien Grenier , Ghjuvan’Ghjacumu Shackleford , Robert Fledrich , Cosima Fonte , Julien Branchu , Marie Goulard , Catherine De Waele , Frédéric Charbonnier , Michael W Sereda , Etienne-Emile Baulieu , Michael Schumacher , Sophie Bernard , Charbel Massaad Lithium enhances remyelination of peripheral nerves Proceedings of the National Academy of Sciences (2012) doi: 10.1073/pnas.1121367109

Je ne sais pas comment cela peut arriver par accident : les gels pour Akt phosphorylé et GAPDH sont évidemment très similaires, juste recadrés et assombris différemment. Le cas suivant, trouvé par Clare Francis après que j’aie invité ce détective de l'intégrité de l'image à la fête de Massaad, est encore plus difficile à expliquer par une erreur innocente :

Amalia Trousson , Joelle Makoukji , Patrice X. Petit , Sophie Bernard , Christian Slomianny , Michael Schumacher , Charbel Massaad Cross-talk between oxysterols and glucocorticoids: differential regulation of secreted phopholipase A2 and impact on oligodendrocyte death PLoS ONE (2009) doi: 10.1371/journal.pone.0008080


Ceci est un exemple de cytométrie défectueuse, où le même échantillon est présenté comme deux échantillons totalement différents, grâce à un re-gating post-mesure. De manière pratique, les nombres de quantification deviennent également différents. Les motifs de cellules en surbrillance (chaque point est une cellule détectée par FACS) sont une révélation que les échantillons de 24h et 48h sont en fait le même échantillon ressuscité.

Il y a des indices selon lesquels au moins une partie de la réutilisation des données pourrait avoir eu lieu en pleine connaissance de Massaad. Même si un directeur de laboratoire n'a aucune idée de toute manipulation de données numériques, ce même directeur doit sûrement remarquer quand les chiffres sont réutilisés dans ses articles, comme il l'a fait dans Grenier et al 2004 et Grenier et al 2006. Clare Francis a également remarqué ceci :

Ghjuvan’Ghjacumu Shackleford , Joelle Makoukji , Julien Grenier , Philippe Liere , Delphine Meffre , Charbel Massaad Differential regulation of Wnt/beta-catenin signaling by Liver X Receptors in Schwann cells and oligodendrocytes Biochemical Pharmacology (2013) – doi: 10.1016/j.bcp.2013.02.036



Les figures 3 et 1B de ce papier sont notamment réutilisées à partir d'un papier Massaad antérieur. Même si c’est dans un contexte similaire cette fois, ce n'est pas ainsi que la science est censée fonctionner. Les auteurs ont formaté les figures différemment, ce qui sert vraisemblablement de reproduction expérimentale.

Joelle Makoukji , Ghjuvan’Ghjacumu Shackleford , Delphine Meffre , Julien Grenier , Philippe Liere , Jean-Marc A Lobaccaro , Michael Schumacher , Charbel Massaad Interplay between LXR and Wnt/β-catenin signaling in the negative regulation of peripheral myelin genes by oxysterols Journal of Neuroscience (2011) doi: 10.1523/jneurosci.0761-11.2011

Cet article a ses propres problèmes : pour une raison quelconque, les auteurs n'étaient pas satisfaits de leurs résultats et ont décidé de jouer un peu avec leur bibliothèque de contrôles de chargement.

L'ancien président de l'Université Paris-Descartes auquel Masaad entendait succéder, était jusqu'en 2019 Frédéric Dardel, désormais conseiller spécial de la ministre française de la Recherche et de l'Innovation, Frédérique Vidal. Dardel s'est qualifié pour ce nouvel emploi parce qu'il a défendu les papiers de Vidal contre les preuves que j'ai publiées sur mon site, alors que la ministre me menaçait de poursuites.

L'un de ces articles de Vidal a même été rétracté, par le Journal of Biological Chemistry, le reste étant apparemment sauvé parce qu'un ministre du gouvernement chargé des sciences ne peut pas être associé à des activités de méconduite en recherche.

Peut-être que Brendon Stell a raison. La science française serait certainement un endroit beaucoup plus paisible et harmonieux sans mon site.

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